运动功能障碍的原因错综复杂，既可能与运动习惯和运动姿势相关，也可能与运动器官退化或老化有关，还可能与个人体质有关。这些原因都不难理解，但很多人可能并不知道，运动功能障碍还可能与急性运动损伤高度相关，即便那些损伤早已康复。
相关研究显示，肩、颈、脊柱、膝、踝、肘、腕等处的急性损伤都可能会引发长期甚至永久性的运动功能障碍，其中又以踝、腰（腰椎）两个部位最为显著。
举个例子，很多人在年少的时期双腿健壮有力，没有代偿和畸形，但在若干年之后却出现O形腿、X形腿、外八字、Q角增大、扁平足、高足弓等运动功能综合征，经过综合诊断，最终发现与踝关节运动姿势错误有关，再做考据，才发现居然是若干年前的一次崴脚的经历改变了原本正确的运动姿势。
人体是一个复杂的系统，几乎每一个人体功能都有“冗余设计”，当踝关节某侧被扭伤时，身体会将重量压到其他位置及健侧，甚至会利用膝、髋、脊柱的动作加以代偿，久而久之，必将形成固有的、畸形的习惯。当扭伤的踝关节功能终于恢复，运动神经和运动器官却适应了新的工作方式，再加上患处的神经和肌肉已不再协调和强健，极易出现永久性的动作功能障碍。
再举个例子。有人在弯腰搬运重物时不幸扭伤腰部肌肉。腰椎关节和踝关节有两个相似之处：1、布满众多细小的软组织，2、很难得到休息和静养；也正因为如此，腰伤很难迅速痊愈。伤久不愈的腰伤会改变原有的动作，改变常规运动姿态，并使患侧的肌肉及神经功能退化，运动功能障碍就此诞生。即便腰伤有朝一日得以康复，已经形成的运动功能障碍却不会自行消失。
当然，由此而引发的运动功能障碍是可以避免的。急性运动损伤之后的第一件事当然是休息，但在休息的过程中要进行力所能及的锻炼，在有条件的情况下可进行更加积极的康复训练。当伤病痊愈后，应采用科学的纠正性训练让原有功能得以恢复，最大程度地避免运动功能障碍的产生。
